V sklopu projekta LIFE TRŠCA redno izvajamo popise vodnih ptic in ptic trstišč, saj so ti ključni za spremljanje stanja populacij in učinkovitosti ukrepov za obnovo ter izboljšanje habitatov na Cerkniškem jezeru. Trstičja, ki jih projekt obnavlja in vzdržuje, so namreč pomembni habitati za številne ogrožene vrste ptic, kot sta rjavovrati ponirek (Podiceps grisegena) in kostanjevka (Aythya nyroca), ter omogočajo uspešno gnezdenje in preživetje tudi drugih živali.
Poleg aktivnosti v okviru projekta LIFE TRŠCA se vsako leto izvede tudi januarski popis vodnih ptic, ki ga organizira DOPPS v okviru mednarodnega popisa IWC (International Waterbird Census). Ta redni popis omogoča spremljanje dolgoročnih trendov populacij, oceno vpliva podnebnih sprememb in človekovih dejavnosti ter zagotavlja pomembne podatke za upravljanje in varstvo ptic na evropski ravni.
S kombinacijo teh popisov projekt LIFE TRŠCA prispeva k ohranjanju biotske raznovrstnosti mokrišč in k trajnostnemu varstvu ptic, katerih preživetje je vse bolj odvisno od naše odgovornosti in strokovnega znanja.